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防治措施针对芝棒污染原因和引发途径，生产上，要掌握灵芝品种的特征特性，提供适宜其生长的环境条件，规范操作，并贯彻为主的方针，避免或减少芝棒感染杂菌。选用优良品种，对退化品种进行提纯复壮选用抗病性强、生活力强、高纯度的菌种进行接种。经多年试验示范，以采收子实体为主的菌株“日本赤灵芝”，采芝、收粉兼用型菌株“黄山8号”两个优良菌株较适宜我省气候特点及段木熟料灵芝栽培模式，由于栽培多年，该两个品种有退化趋势，需进行提纯复壮。科学安排栽培季节根据中原地区气候特点，短段木灵芝菌棒制作期选在11月上旬至翌年2月上旬为宜，在此时段内，为让菌丝有足够的发菌时间，宜利用当地气候资源，提早制作菌棒。
我国是世界上三大锻木（原木）灵芝产区之一（另有韩国、日本），产量占世界总产量的50%以上。浙江从1989年开始灵芝人工栽培试验并取得成功，1992年农民利用纯锻木仿生法大规模栽培灵芝，产业化经营至2007年，平均每年锻木投放量3000立方米（高时达7000立方米），年产干灵芝150吨，占全国总量的四分之一。2008年以来浙江省中药产业协会将灵芝重点扶持产业，市场上灵芝产品越来越多，包括灵芝子实体、抱子粉、菌丝体为主要成分的和药品，广泛应用于肿瘤、冠心病、心绞痛、高脂血症、高血压病、、慢性支气管炎和哮喘、神经衰弱、肝炎等。但国内外灵芝药材及其产品均无系统的质量控制体系，对灵芝及其产品质量的控制大多都停留在主要活性成分定性评价的水平上，灵芝品种使用也是几十年一成不变，单一品种的重复使用，菌种种性退化明显，与“、有效、稳定、可控叩勺中药现代化、国际化要求存在相当差距，建立灵芝功效成分定性与定量结合的评价方法，控制灵芝及其产品质量，对灵芝产业可持续发展具有重要意义。
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《宋史》中写到及至南宋庆元五年八月，“太室西北夹室楹生白芝四叶，前史以白芝为丧祥”，似乎像被命运安排好一样“明年八月，国连有大丧”。灵芝在早期文献记载中的明确考证第1个是从《神农本草经》考证。《神农本草经》是中国现存部完整的药物学著作，它集合了很多医学著作，创作于公元前，总结了汉代以前的所有的药物学知识。第2个是《神农本草经》中将灵芝分为上、中、下三种，《神农本草经》中记载的上品灵芝多达120种，长时间服用能够使身体轻盈，血气充足，进而达到，而中品也有120种，能够治疗疾病，补气养血。下品有125种，能够去除寒气，疏络筋脉，可以作为辅药。总计记载的灵芝有365种。其中上品的灵芝中有不少学名：赤芝、黑芝、青芝、白芝、黄芝、紫芝。《神农本草经》中还对上述的6种灵芝进行了详细描述。与当代的各类医学著作进行比较，我们可以清楚地发现，《神农本草经》对灵芝的药物性质、主要治疗的疾病的描述，相差不大。这与魏朝和晋朝之后的医药专家以严谨的态度看待被神化的芝草有关。其中这6种灵芝的药效在现代医学验证下也已经得到了很明确的验证。因此，所载六芝的药效被古今药物学家不断地验证，《神农本草经》中的六芝与现代医学中的灵芝很相近。
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